Das Institut für Systemische Entzündungsforschung (ISEF) ist 2008 aus dem Institut für Immunologie und Transfusionsmedizin hervorgegangen. Es  vertritt das Fach Immunologie an der Universität zu Lübeck (UzL) in Forschung und Lehre. Als Forschungsinstitut ist es eingebettet in die Sektion Medizin der UzL ohne Aufgaben in der Krankenversorgung.
Das Ziel des ISEFs ist es herausragende immunologische Grundlagenforschung sowie wegweisende translationell-immunologische Forschung zu betreiben. Der Schwerpunkt  liegt im Bereich der Wechselwirkungen zwischen dem angeborenen und dem erworbenen Immunsystem. Im Einzelnen fokussieren die drei am ISEF ansässigen Arbeitsgruppen auf:

• Das Komplement System und seine Rolle im regulatorischen Netzwerk des angeborenen Immunsystem. Von besonderem Interesse ist die Bedeutung der Wechselwirkungen des Komplementsystems mit anderen Immunsensoren für die Entwicklung von akuten und chronisch-entzündlichen Erkrankungen wie dem allergischen Asthma, Immun-Komplex Erkrankungen und der Sepsis.
• B Zell-Differenzierung, Homing und Interaktion mit ihren spezifischen  Mikrokompartimenten (Nischen) in lymphatischen und entzündeten Geweben und ihre Rolle für die Entwicklung von allergischen Erkrankungen, Autoimmunerkrankungen sowie B Zell Tumoren.
• Die Mechanismen, die zur Produktion anti-inflammatorischer Antikörper aus Plasmazellen führen sowie die Rolle solcher Plasmazellen für die Entwicklung und Aufrechterhaltung von Antigen-spezifischer Toleranz.

Das ISEF ist zentral eingebunden in den universitären Forschungsschwerpunkt: „Infektion und Entzündung“, was durch die Mitarbeit in folgenden Verbünden zum Ausdruck kommt:

1. Exzellenzcluster „Inflammation at Interfaces“,
2. SFB/Transregio 22 „Die allergische Immunantwort der Lunge“,
3. Forschungsbereich C des SFB 654 „Plastizität und Schlaf“,
4. Graduiertenkolleg (GRK) 1727 „Modulation von Autoimmunität“
5. Schwerpunktprogramm „Autoimmunität“.

Die Wissenschaftler des ISEFs führen viele Ihrer Projekte in Kollaboration mit herausragenden lokalen, nationalen und internationalen Partnern durch. Eine intensive Kollaboration besteht mit den Abteilungen für Molekulare Immunologie und Immunbiologie des Cincinnati Children’s Hospital in Cincinnati, Ohio, USA.